Los visitantes de Balam-Nah podran apreciar el uso de biodigestores en los baños. Son contenedores cerrados, herméticos e impermeables, dentro del cual se deposita materia orgánica dentro de una disolución con agua. La mezcla, mediante la fermentación anaeróbica de los microorganismos, es degradada obteniendo como producto gas metano y un subproducto liquido, denominado bioabono, el cual puede ser utilizado como fertilizante.
Este tipo de tecnología tiene un gran potencial para el cuidado del ambiente ya que disminuye la cantidad de desechos vertidos a los ecosistemas y además se produce una fuente de energía relativamente limpia.
Estas acciones se vinculan con las prácticas amigables con la biodiversidad para el ecoturismo del proyecto Sistemas Sostenibles Productivos y Biodiversidad, específicamente con la práctica 8 Manejo integral de residuos